Un 9 de julio pero de 1932 se fundó el Club Social y Deportivo Muñiz. Los colores de su conjunto son rojo y blanco y por eso se lo conoce como «Rayo Rojo».
La primera afiliación a la Asociación del Fútbol Argentino tiene lugar en 1956, pero el club se desafilia voluntariamente en 1964. Vuelve a participar de los torneos de AFA en 1980 y en 1981 logra el ascenso a la Primera C, la cuarta división del fútbol argentino. En abril de 1980 inaugura su estadio, que después debe abandonar. A lo tener estadio propio hace de local en el Club Atlético San Miguel, en el Club Deportivo y Social Juventud Unida (ambos clásicos rivales del Rojo) y en la actualidad en el Municipal de Pilar.
El club obtiene su primer título en la temporada 1986/1987, al consagrarse campeón de la Primera D. Pierde la categoría en siete oportunidades (1964, 1990/91, 1994/95, 2001/02, 2005/06, 2007/08 y 2009/10), por tener el peor promedio de la última división, debiendo permanecer inactivo (desafiliado) por una temporada. El equipo regresa para la temporada 2011/2012. Ese mismo año participa por primera vez de la Copa Argentina pero no logró superar la primera ronda al perder frente a Deportivo Español.
Continuó jugando en la Primera D hasta la actualidad, tuvo la posibilidad de participar en dos Copas Argentinas más, frente a Sportivo Barracas que lo derrotó por penales pero luego caería de la misma forma ante Central Ballester y en la próxima temporada caería ante Excursionistas.
El máximo logro fue el ascenso a la Primera C por el Reducido mientras que la máxima goleada fue 9 a 0 frente a Acassuso en 1981.
¡Feliz Aniversario Rayo Rojo!